首先是导师常给我们说的【what】，即我们要做什么，这便是问题的提出。
问题的提出很重要，也很困难。选题是决定一篇文章是否能被发表的最重要的因素。Lancet评定论文质量的9条标准中3条与选题有关：1、The subject addressed in this article is worthy of investigation? 2、The hypothesis is clearly stated? 3、 The data presented are new (or deserved to be replicated )? 如何选题主要考虑以下几个方面，我们看看自己能够从哪个方面去提出问题：
1、对科研工作中的发现进行总结；
2、为相关政策和指南的制定提供依据；
3、解决临床实践中的具体问题；
4、在文献学习中受到启发；
5、在分析数据过程中的新发现……
其次是【why】，即我们为什么做这篇文章。
资料的搜集和阅读是论文写作的基础。一篇论文的意义很大程度上取决于对既往研究的总结。这是评定论文质量的必须指标之一。如Lancet：The most important previous studies are cited as far as I know?
撰写自己的文章之前，我们【必然】要检索相关领域的进展，这种准确全面的检索能力是必须掌握的（我就在这方面吃了好几次亏，自己找不到文献，老师一找就找到了，这样会很耽误自己的研究进度）。通过看这个领域的进展，我们才能知道目前这个方向已经做了什么，还有什么没做，或者还有什么需要进一步验证，只有这样，我们才能找到自己科研的切入点。这一过程也可以定义为国内外研究现状及不足的总结。搜集和阅读资料需注意的问题：
1、应在动笔前完成；
2、一定要对既往研究进行认真总结，不要随意说“未见报道”、“首次报道”等。
3、“没有既往研究并不说明本研究有价值”。
第二，动笔之前，要【构思和拟定学做提纲】。
写作过程是很繁重的，所以我们必须有个指导性文件来给我们清醒的认识，使我们不走错路，浪费了宝贵时间。提纲的重要性体现在以下几点：
1、是论文的框架；
2、把整篇文章的写作分成多个具体的任务；
3、对不同部分进行整理，使之更有逻辑性；
4、在动笔之前发现可能存在的问题并进行修正。
如何撰写提纲可以遵照以下几点（我就不翻译了，翻译的不好）：
1、Develop a central message of the manuscript
2、Summarize the questions and problems
3、Define the materials and methods
4、Define the principal findings and results
5、Describe the conclusions and implications
6、Organize and group related ideas together
7、Identify the references that pertain to each key point
我觉得最主要就是我们写的这篇文章要有一个很明确的方向，我们一定要把我们所得到的材料，以及结果凝练统一，结果主要的问题，不要泛泛而谈，说了好多问题和结果，谁也不挨着谁，让人摸不到头脑。一定要保持一颗高度清醒的头脑，知道自己在解决什么，什么样的结果可以阐述我得问题。
第三、开始撰写论文
1、首先要知道论文撰写的基本格式
国际医学期刊编辑委员会（ICMJE）制订的《生物医学期刊投稿的统一要求》(Uniform requirements for manuscripts submitted to biomedical journals) (网址 http://www.icmje.org/) 于1979年由美国国立医学图书馆第一次公布，以后经多次修订，被称为温哥华格式. 我国在1987年公布《科学技术报告、学位论文和学术论文的编写格式》 （GB7713-87）文件。期刊每年的第一期，刊出该刊论文及参考文献的格式要求。各杂志网站 Guide for authors / Instruction to authors 会刊登该刊的具体要求。以下是基本的格式示意图（每个部分不同杂志会有不同的要求，投稿前需按照杂志来修改）：
6、资料和方法的撰写
资料与方法部分是衡量论文科学性的重要组成部分，目的是为研究结果的产生提供依据，并可供他人进行重复和验证。如Lancet的标准中有2条与之有关：1）、The research design is suitable? 2）、The methods are described specifically enough to be evaluated? 这一部分的撰写要点包括：
1）涉及新的内容时，应详细而便于同行重复、借鉴。常规方法或重复前人的方法则注明文献出处即可。
2）描述要详尽、准确。原则是能足以据此评价本研究的结果和结论是否可信，并足以让其他研究人员按条件重复本研究。
3）英文论文此部分占1/4至1/3左右。
8、讨论部分的撰写要求
讨论是对结果的思考、分析和科学推理，从广度和深度两方面来丰富和提高对结果的认识，为论文的结论提供理论上的依据。
讨论能否深入展开，在很大程度上取决于作者的【学术水平、分析能力和写作能力的高低以及文献占有量的多少】。Lancet标准中的2条与之有关：1）The discussion addresses sources of systematic and random error? 2、The conclusions are supported by the data? 讨论的主要内容：
1）陈述主要发现
2）本研究同其它研究比较的长处和短处；特别要讨论结果中的差别
3）研究的意义：可能的机制和临床医生或决策者的使用前景
4）未解答的问题及今后的研究方向
5）本研究的局限性
9、结论
结论是对结果和讨论作出的高度概括的论断，是论文的最后归宿。好的结论会给审稿人清晰的判断你的文章如何。Lancet标准中的一条：The conclusions are supported by the data? 结论主要包括：
1）解决了什么问题，
2）总结发现的规律，
3）对前人的研究或见解作了那些修证、补充、发展、证实或否定
